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Les collectivités territoriales amenées à participer à la campagne de vaccination doivent "respecter les règles de protection des données qui leur sont applicables", rappelle la Cnil dans un article publié sur son site le 19 février 2021. L’autorité administrative souligne que le rôle et le périmètre des collectivités territoriales en matière de collecte de données se limitent au cadre de la stratégie vaccinale pilotée par l’État. Elles doivent notamment évaluer la nécessité du traitement des données et respecter les critères du ciblage d’information, de la prise de rendez-vous et du suivi des vaccins.