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Le programme Sirhen fera l'objet d'une "période probatoire" avec une phase de généralisation sur l'ensemble des académies en mai 2014 "sur une population restreinte", puis un "déploiement sur une population plus importante" début 2015, selon un "point de situation" présenté en CTM le 9 avril 2014 par le ministère de l’Éducation nationale, de l'Enseignement supérieur et de la Recherche. "Enjeu opérationnel majeur du ministère", Sirhen doit "répondre à une forte échéance technique" du fait de "l’obsolescence des applications existantes, tant fonctionnellement que technologiquement". Il propose au comité de "rendre compte de l'évolution du programme devant un groupe d'experts que les organisations syndicales voudront bien désigner".
Par un arrêt du 28 mars 2014 (n°361042), le Conseil d’État rejette le recours du Snes-FSU contre le décret n°2012-342 du 8 mars 2012 portant création d’un traitement automatisé de données à caractère personnel dénommé Sirhen, destiné à assurer la gestion des ressources humaines des personnels des ministères de l'Éducation nationale et de l’Enseignement supérieur. Il rejette les nombreux moyens et en particulier celui fondé sur l’interconnexion avec le fichier « SI paye » car "la mise en relation" de ces deux fichiers correspond "au même intérêt public" de gestion des personnels. Seule exception : la mention du sexe et de la nationalité des conjoints ou partenaires des personnels qui n’est justifiée par "aucune nécessité ou utilité" et présente donc un caractère "excessif". Bernard Toulemonde, Igen honoraire, analyse cette décision pour AEF.
À la suite de l'annonce par le gouvernement de l'arrêt de l'ONP (Opérateur national de paye), la CGT administration centrale demande le 13 mars 2014 un "moratoire immédiat" sur le projet Sirhen du ministère de l'Éducation nationale. Le SNPTES estime quant à lui "nécessaire que le développement de Sirhen continue en s'appuyant sur les ressources internes". Le syndicat dénonce le recours à "des sociétés privées au détriment de l'Éducation nationale", tout comme la CGT qui "exige une vraie ré-internalisation" du chantier informatique.
Les dépenses informatiques de l'Éducation nationale s'élèveront à 77,23 millions d'euros en AE (autorisations d'engagement) et 83,12 millions d'euros en CP (crédits de paiement), selon le projet annuel de performances 2013 de la mission enseignement scolaire. Le document signale que « les orientations pour 2013 portent sur la poursuite des projets pluriannuels de rénovation des SI (systèmes d'information) et principalement sur la refonte des systèmes d'information des ressources humaines du ministère de l'Education nationale » avec le programme Sirhen (AEF n°204773). Les autres grands projets sont « Ocean », outil de gestion des examens et concours, Choregie pour fédérer les chantiers liés au SI de gestion financière et comptable de l'État Chorus, et la « refonte » de GFC décrite comme une « adaptation à la Lolf du cadre comptable des EPLE (lycées et collèges publics) » et une « conception d'un SI de gestion financière et comptable dans une nouvelle architecture ».
Un « traitement automatisé de données à caractère personnel dénommé 'Sirhen' » (AEF n°311562) est créé par décret publié au journal officiel du 10 mars 2012 (AEF n°219443) pour assurer la gestion des ressources humaines du ministère de l'Éducation nationale, de la Jeunesse et de la Vie associative et du ministère de l'Enseignement supérieur et de la Recherche en lien avec l'ONP (opérateur national de paie). Ce SIRH (système d'information ressources humaines) « permettra le raccordement » au nouveau système d'information interministériel ONP chargé d'assurer la paie des traitements, salaires et accessoires des fonctionnaires et agents de l'État. L'avis de la Cnil est également publié au même journal officiel. Le raccordement de Sirhen à l'ONP doit se faire en 2013, et « la liquidation des premières payes en 2014 ».
La refonte du système d'information ressources humaines de l'Éducation nationale représente un gros enjeu par la taille du ministère et le nombre des effectifs concernés, 1,1 million de personnes, indique à l'AEF Thierry Le Goff, directeur général des ressources humaines des ministères de l'Éducation nationale et de l'Enseignement supérieur et de la Recherche. Le principe retenu pour ce chantier, dénommé SIRHEN, est de parvenir à une bascule complète vers un nouveau système à l'horizon 2011-2012, selon une mise en œuvre par paliers successifs. Le chantier est motivé par la volonté de faire évoluer techniquement l'existant: "L'Éducation nationale a une antériorité par rapport à d'autres ministères sur le développement des systèmes d'information et l'intégration des modalités de gestion. Nous avons par exemple dématérialisé depuis de nombreuses années les opérations de paye, il faut désormais assurer une mise à jour de l'ensemble du système."