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« Le site de Montpellier-Perpignan présente seulement 36 % d'écoles notées A+/A contre 64 % évaluées B/C », note l'Aeres (Agence d'évaluation de la recherche et de l'enseignement supérieur) dans la « synthèse des évaluations des écoles doctorales réalisées en 2009-2010 dans le cadre de la vague A de contractualisation 2011-2014 », rendue publique mardi 28 juin 2011. « Ce point peut en partie s'expliquer par les faiblesses relevées sur le suivi et l'insertion des doctorants », précise l'agence, pour qui cette exception mise à part, « la répartition des notations (…) est relativement homogène » pour les autres sites de la vague, à savoir Bordeaux-Pau (82 % de A+ et de A), Toulouse (93 %), Lyon-Saint-Étienne (86 %) et Grenoble-Chambéry (79 %).
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Les écoles doctorales de la « vague D » qui relèvent des domaines des sciences de la vie et des sciences humaines et sociales ont « de très gros progrès à faire » en matière de suivi et d'insertion professionnelle de leurs doctorants, note l'Aeres qui met en ligne la synthèse de ces évaluations, mercredi 19 mai 2010. Les 74 écoles doctorales des établissements de la « vague D » (2010-2013) se concentrent pour l'essentiel en Île-de-France (66 écoles) ; six écoles sont dans la région Nord-Pas-de-Calais et deux sont en Outre-mer (Antilles-Guyane et Réunion). Leur répartition par disciplines est la suivante : 21 écoles en sciences dures, 15 en sciences de la vie et 38 en sciences humaines et sociales.
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L'Aeres souligne le « rôle structurant » des écoles doctorales de la vague contractuelle C (académies de Strasbourg, Nancy-Metz, une partie de l'Île-de-France) mais pointe « l'insuffisance des moyens en personnels et en locaux » à leur disposition. L'agence a mis en ligne la synthèse de l'évaluation des 72 ED (écoles doctorales) de la vague C, effectuée en mai et juin 2008 par des comités d'experts, qui se sont rendus sur place.
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Les écoles doctorales éprouvent une "grande difficulté" à "exister vraiment", mais ont un "rôle indéniablement et réellement structurant" sur "le paysage universitaire d'un site". Tels sont les deux constats que dresse l'AERES, dans sa "synthèse de l'évaluation des écoles doctorales de la vague B", mise en ligne sur le site Internet fin janvier 2008. Il fait suite à l'évaluation des 71 écoles doctorales de la vague B, réalisée entre mi-septembre et début décembre 2007. L'agence publie d'ailleurs dans le même temps sur son site un document effectuant un "retour d'expérience des comités de visite des écoles doctorales".
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